Bu ders tez çalışmalarına yönelik araştırma metotları, araştırma konularının ve sorularının belirlenebilmesi, hipotez oluşturulması, istatistiksel deneysel tasarım yöntemleri, optimizasyon deneyleri, deneysel tasarım yöntemlerinin uygulanabilmesi için bilgisayar yazılımı kullanımını ve bilimsel araştırmalarda etik konularını kapsamaktadır.

Bu ders korunum denklemleri ve sınır şartları, akma direnci ve momentum geçişi mekanizması, sınır tabaka akımları, türbülans modellemesi, ısıl iletkenlik ve enerji taşınım mekanizması, ısıl sınır tabakalar, difüzyon ve kütle transferi mekanizması, konsantrasyon sınır tabakası ve basit geometrili taşınım problemlerinin sayısal çözümünü kapsar.

Bu ders hücre yapısı, DNA, RNA, protein, hücre zarı, hücre iskeleti, hücresel sinyal iletimi, hücre döngüsü ve kanseri kapsamaktadır.

Bu ders biyomoleküler ve hücresel özellikler, fizyolojik özellikler, biyomekanik, biyocihazlar, biyogörüntüleme ve işaret işleme, biyoteknoloji, bağışıklık mühendisliği ve biyomateryalleri kapsar.

Bu ders fermantasyon ve fermantasyon proseslerine giriş, endüstride kullanılacak olan mikroorganizmaların seçimleri, biyoproses tipleri ve ilkeleri, kesikli, sürekli ve kesikli-beslemeli üretimler, çeşitli fermente ürünlerin üretim prosesleri ve endüstriyel üretimlerde izlenen teknolojik basamaklarını içermektedir.

Bu ders biyoyakıtlara giriş, biyoyakıt kaynakları, biyoyakıt üretim süreçleri, enerji ve kütle denkliği hesaplamaları, biyoyakıt üretiminin ve de tüketiminin ekonomik ve çevresel etkilerini kapsar.

Bu ders, enzimlerin kimyasal yapısı ve özellikleri, enzim spesifikliği, enzim çeşitleri ve fonksiyonları, enzimatik reaksiyonlar ve enzim kinetiği, enzim aktivitesi üzerine etki eden faktörler, enzim stabilitesi ve önemi, enzim bilimi ve teknolojisindeki yeni gelişmeler ve mühendislik bilgilerinin enzim teknolojisinde kullanımı, ,mmobilize enzimler ve immobilizasyon teknikleri ve uygulama alanlarını kapsamaktadır.

Ders biyotasarım temel ilkeleri, yöntemleri ve uygulamaları ile endüstriyel ve mekanik süreçlerde biyolojik yaklaşımlara dair konuları kapsar.

Biyosistemler için tasarım yöntemleri hakkında bilgi edinme, yöntemi uygulama, sonuçları düzenleme, tartışma ve raporlama.

Gen terapisi, viral ve viral-olmayan gen aktarım teknikleri

Bu ders epigenetik, DNA modifikasyonlari, histone modifikasyonlari, kanser, yaşlanma, metabolik hastalıklar ve nörolojik hastalıkları kapsar.

Proteinlerin yapısı ve fonksiyonları, enzim mekanizmaları, proteinlerin katlanması, protein mühendisliği

Bu ders biyomimetik yapılar, biyolojik yapılar ve biyomimetik uygulamalar ile tıbbi alanda biyomimetik konularını içerir.

Bu ders biyolojik yapılar, biyofizik uygulama alanları, biyofizikteki farklı yöntem ve teknikler ile taşınım olaylarını içerir.

Bu ders Python dilinin biyoenformatik uygulamalarında kullanım temelleri temel biyoenformatik problemlerine giriş yapar. Python dilinin temellerinin tanıtılması ile başlar. Bu bölümde python dil kuralları öğrencilere anlatılıp, python kullanarak biyolojik verilerin analizi üzerine odaklanılacaktır. Daha sonra yeni nesil dizileme verileri, evrimsel akrabalık analizleri, tek nükleotid polimorfizm ve kopya sayısı polimorfizm tespiti gibi biyoenformatik problemlerinin tanıtılması üzerine durulacaktır.

Bu derste fonksiyonel oligonükleotidlerin tanıtılması, doğal ve sentetik oligonükleotidklerin kimyasal yapısı, katlanma sonrası üç boyutlu yapıları ve bu yapıların oluşumundaki kuvvetler tartışılır. Fonksiyonel oligonükleotidlerin kullanım alanları ve yöntemleri tanıtılıp, örnek uygulamaları güncel makaleler üzerinden tartışılır. Yapay oligonükleotid problarının sentez yöntemleri anlatılır. Sentezlenen yapılarda kullanılan kimyasal değişiklikler ve bu değişikliklerin fonksyonel etkileri örnekler üzerinden anlatılarak, uygun değişikliklerin uygulamaya bağlı olarak seçebilme yeteneği kazandırmayı amaçlar.

Bu ders polimerik malzemelere giriş, polimerlerin yapısı ve sınıflandırılması, polimerlerin özellikleri, plastiklerin üretim yöntemleri, karıştırma, şişirme ile kalıplama, enjeksiyon ile kalıplama ve çok tabakalı kaplama yöntemlerini kapsar.

Bu ders temel tıbbi görüntüleme teknolojilerinin çalışma prensipleri, tıbbi görüntü verisinin saklanması, görselleştirilmesi ve işlenmesini kapsar.

Bu ders nanomalzemelerin fabrikasyonu ve sentezi, boyuta bağlı özellikleri, karakterizasyonu ve uygulamalarını kapsar.

Aşı geliştirilme yöntemleri, aşı geliştirmede karşılaşılan zorluklar, immünoterapi metodları, genetik uygulamalar ve klinik yansımaları

Bu ders yaşam döngüsü kavramının temel tanımını, yaşam döngüsü kapsamında ele alınan çeşitli orta nokta ve son nokta çevresel, ekonomik ve sosyal etkileri, yaşam döngüsü envanteri hazırlamayı ve yaşam döngüsü analizi gerçekleştirme konularını kapsar.

Otomatik öğrenme, geçmiş deneyimleriyle otomatik olarak performanslarını iyileştiren bilgisayar programları ile ilgilenir. Yapay zeka, istatistik, bilgi kuramı, biyoloji ve kontrol teorisi gibi bir çok alandan ilham alan otomatik öğrenme dersinde aşağıdaki konular işlenecektir; Konsept öğrenme, Karar ağacı öğrenme, Yapay sinir ağları, Temelli öğrenme, Evrimsel algoritmalar, Destekli öğrenme, Bayes öğrenmesi, Hesapsal öğrenme teorisi.

Akıllı Etmenler; Problem çözme ve Arama: düzenli ve sezgisel arama, A*, yerel arama ve optimizasyon; Kısıt sağlama problemleri; Oyun oynama ve rekabet ortamında arama; Mantıksal muhakeme. Önerme mantığı. Birinci seviye mantık. Birinci seviye mantıkta çıkarsama; Planlama; Belirsizlik altında muhakeme. Bayes kuralı. İnanç ağları. Karar vermek için inançları kullanma. İnançları öğrenme; Pekiştirmeli Öğrenme

Kullanıcı arayüzü temel prensiplerini öğretmek. Kullanılırlık model ve prensiplerini öğrenciye tanıtmak. Kullanıcı ve görev analizini öğrenciye yaptırmak. Tasarım, prototip geliştirme ve değerlendirme işlemlerini öğrenciye proje yaptırarak öğretmek. Yeni kullanıcı arayüzü teknikleri öğretmek. Kullanıcı odaklı araştırmaların nasıl yürütüleceğini öğretmek.

Kesirli sayılar aritmetiği, hesaplamalı lineer denklemler, lineer olmayan denklemlere iteratif çözümler, enterpolasyon, sayısal integral, ODE lere sayısal çözümler ve sayısal çözümlemeler için genel bilgisayar programları.

Görüntü süzgeçleme ve dekonvolüsyon, öz-görüntüler, gürültü indirgeme ve onarımı, renkli görüntü işleme, çok çözünürlüklü işleme, görüntü sıkıştırma, morfolojik görüntü işleme, ölçek-uzay teknikleri, öznitelik çıkarımı ve tanıma, görüntü eşikleme / bölütleme, görüntü kayıtlama ve eşleştirme.

Örüntü tanıma algoritmalarının temellerini ve uygulamaları, istatistiksel karar kuramı, istatistiksel sınıflama, en büyük olabilirlik Bayes kestirimi, parametrik olmayan yöntemler, öznitelik çıkarımı, öznitelik seçimi, doğrusal sınıflayıcılar, sinir ağları, metrik olmayan yöntemler, eğiticisiz öğrenme ve öbekleme.

Biyomolekülsel ve Hücresel Özellikler, Fizyolojik Özellikler, Biyomekanik, Biyocihazlar, Biyogörüntüleme ve İşaret İşleme, Biyoteknoloji, Bağışıklık Mühendisliği, Biyomateryaller

Gerçel analiz. Cebrik yapılar. Doğrusal uzaylar ve doğrusal dönüşümler. Durum denklemleri. Çözümlerin varlığı ve tekliği. Dinamik sistemlerin özellikleri. Zamanla değişmeyen ve değişen doğrusal dinamik sistemler için durum geçiş matrisi. Sıfır-durum çözümü. Sıfır-giriş çözümü. Minimal polinom ve Cayley-Hamilton teoremi. Özdeğer ve özvektörler. Jordan biçimi. Liapunov anlamında kararlılık. Sınırlı-Giriş Sınırlı-Çıkış kararlılığı. Yönetilebilirlik ve gözlenebilirlik. Minimal gerçekleme

Bu ders ileri matematiksel optimizasyon problemleri, formları, modelleri ve uygulamalarıyla alakalı doğrusal cebir kavramlarıyla ilgili gerekli materyalleri temin etmektedir.